南平海关是受福州海关直接领导，按授权负责南平市行政辖区（不含武夷山市行政辖区）海关各类管理工作的执行机构。负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；承办上级交办的其他工作事项。
机构设置：
（一）内设机构：办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、综合业务科、企业管理科、查检一科、稽查科。
（二）派驻机构：驻邵武办事处（副处级）
办事地址：
机关本部：福建省南平市延平区江滨南路6号海关大楼；
驻邵武办事处：福建省南平市邵武市熙春中路188号。
联系方式：0599-8620440、0599-8933631
负责人姓名：廖鲁兴
